Para o primeiro semestre de 2013, o Programa dispõe de 5 bolsas de estudo CAPES por 12 meses, renováveis por mais 12 meses, conforme avaliação de desempenho do bolsista, e mais uma bolsa no segundo semestre de 2013.

As bolsas são destinadas a alunos em dedicação exclusiva. Os candidatos interessados deverão apresentar um pré-projeto de pesquisa elaborado em tema identificado com uma das linhas de pesquisa do programa até 30 de janeiro de 2013. Os projetos serão submetidos à Comissão de Bolsa que entrevistará todos os candidatos. De acordo com a disponibilidade anual de bolsas de estudo, o Programa atenderá os alunos que obtiverem melhor resultado classificatório de avaliação, segundo a lista divulgada dos candidatos selecionados na entrevista e que preencherem os requisitos exigidos pela CAPES e pelo CNPq.

No caso de bolsas de estudo ficarem disponíveis ao longo do ano, por desistência ou reprovação do beneficiado, haverá processo de seleção entre os demais mestrandos interessados, preferencialmente entre mestrandos de mesmo ano de ingresso do beneficiado anterior.

Os alunos que obtiverem Bolsa deverão assinar um termo de compromisso. O modelo pode ser obtido na Secretaria do Programa.

A FAPESP oferece bolsas diretamente ao mestrando (critérios atualizados em http://www.fapesp.br